备案制度。根据《条例》第八条规定特许人从事特许经营活动要进行备案。尽管备案与否对于加盟合同效力的影响存在很大分歧，但未备案毕竟是违法的，直接影响特许人的声誉和人们对特许人的主观评价。而且备案情况属于特许人向被特许人进行信息披露的内容，如果隐瞒这一情节，则被特许人有权要求解除加盟合同。

签收制度。包括收、发货签收，赠品签收，相关知识产权资料、经营指导方案、宣传方案、装修方案等资料的赠送签收。因为人民法院认定被特许人是否收到上述商品、资料，是否接受服务，都是以当事人实际签收为准。如果当事人将来不承认收到特许人向其提供的商品、资料，又无其它证据证明当事人实际签收，则人民法院很难支持特许人的主张，会以特许人未履行了相关发货、赠送的义务为由判决解除合同，最终造成“哑巴吃黄连”的结果。

经营指导制度。首先，这是一项准法定义务，《条例》第七条规定，“特许人从事特许经营活动应当拥有成熟的经营模式，并具备为被特许人持续提供经营指导、技术支持和业务培训等服务的能力。” 第十一条规定，从事特许经营活动，特许人和被特许人应当采用书面形式订立特许经营合同。特许经营合同应当包括经营指导、技术支持以及业务培训等服务的具体内容和提供方式。可见，为被特许人提供经营指导对于扶持被特许人经营和稳定双方合作关系很重要。以前的特许资讯中，笔者也阐述过，经营指导的具体内容，在此不再赘述。虽然经营指导的内容由双方约定，但从法律的要求和立法本意角度出发，这项义务应当构成双方特许经营必不可少的组成部分。所以，特许人应当建立一套经营指导制度，制定具体的指导服务内容、方式，最大程度的扶持被特许人经营，实现特许经营模式的成功复制。

对于物流型的特许人，笔者一直主张建立单一、固定的物流合作伙伴，这样有利于及时快速的查询和责任追究，保障货物输送的畅通。

档案保管制度。将客户资料（包括发货单据、培训记录）建档保管，首先，有利于特许人查询对账。其次，作为证据留存。根据我国有关法律规定，这些资料至少保留两年以上。

协商处理制度。这主要是解决特许人与被特许人在履行合同过程中，难免会因某些原因，一方要求解除合同或者变更合同，那么，此时就要处理好双方的法律关系，如果是解除合同，则要将善后事宜约定清楚，如果是变更合同，则就要将变更后的内容写明，如果解除或变更时都没有做这些约定处理，那么，在一方否认的情况下，合同的效力依然存在，且推定为合同未变更，如果另一方按照双方口头约定履行合同，则一方可能向其主张违约。